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Python使用Statsmodels进行生存分析、协变量分析等生存数据分析

在使用Statsmodels进行生存数据分析之前,需要先安装Statsmodels和相关的类库。可以使用以下命令来安装: pip install statsmodels Statsmodels是一个Python库,提供了用于统计建模和推断的函数,它包含了许多统计模型,用于线性回归、时间序列分析、假设检验等。在Statsmodels中,生存分析是通过`lifelines`类库来实现的。 在进行生存数据分析之前,首先需要导入必要的类库: python import pandas as pd import numpy as np from lifelines import CoxPHFitter 接下来,如果有可下载的数据集,可以使用`pandas`库来加载数据集。例如,我们可以使用`lifelines`自带的数据集`waltons`作为样例数据集: python from lifelines.datasets import load_waltons `waltons`数据集包含了19世纪末期在约克郡的两个教堂中的137名牧师的存活数据。 python data = load_waltons() # 加载数据集 print(data.head()) # 打印前几行数据 数据集的每一行代表了一个观测数据点,其中包含了观测时间和是否事件发生的信息。 完成准备工作后,可以开始实现生存数据分析模型。以下是一个完整的样例代码,使用Cox比例风险回归模型来分析waltons数据集: python import pandas as pd import numpy as np from lifelines import CoxPHFitter from lifelines.datasets import load_waltons # 导入数据集 data = load_waltons() print(data.head()) # 创建CoxPHFitter实例 cph = CoxPHFitter() # 拟合模型 cph.fit(data, 'T', event_col='E') # 打印模型的系数 print(cph.summary) 在这个样例中,我们首先从`lifelines`库中导入了`CoxPHFitter`类,然后加载了waltons数据集。接着,我们创建了一个`CoxPHFitter`实例,并使用`fit`方法对模型进行拟合。最后,我们打印了模型的系数。